概況：口腔基礎醫學教研室創建于1976年，為在國內較早成立口腔基礎醫學教研室的口腔醫學院校之一，教研室最早開設的口腔基礎醫學課程為口腔組織病理學，隨著教研室的不斷發展壯大，相繼又開設、引進和增加口腔解剖生理學、口腔微生物學、口腔生物化學、口腔生理學、口腔材料學等課程。經過幾十年的發展，教研室目前已經形成一支師資力量雄厚、年齡結構合理、多學科交叉的跨學科、集教學、科研和醫療為一體的師資隊伍。
 歷任教研室主任：
1.1976年歐陽喈教授任教研室主任;
2.1998年孫宏晨教授任教研室主任;
3.2005年張澤兵主任醫師任教研室主任;
4.2014年于維先教授任教研室主任。
師資情況：教研室擁有一批教學經驗豐富以教授和博士為主的教師隊伍，教師12名（教授3名，副教授3名，講師3名，助教3名），教輔人員3名。其中訪問學者及歸國學者3人，境外學習經歷8人，博士生導師2人，碩士生導師7人，具有博士學位15人，在讀博士3人。教研室還定期選送中青年教師到國內外名校進行學習和交流，與國內北京大學、四川大學、第四軍醫大學等院校有廣泛聯系。
課程設置和教學設施： 口腔基礎醫學教研室主要承擔口腔解剖生理學、口腔生物學、口腔組織病理學、口腔材料學、口腔醫學專業外語等五門課程以及口腔醫學科研訓練的教學任務，具體包括口腔醫學五年制和七年制的理論課與實驗課。
教改項目和科研成果： 近五年教研室承擔各級教學研究項目7項，其中海外優質課程引進項目1項，省級3項；承擔國家級科研項目10項，其中國家自然科學基金重大國際合作項目1項，重點項目1項，面上項目5項，青年基金2項，其他1項；省級科研項目12項；獲教學成果獎4項，其中省級一等獎1項；獲得國家發明專利4項；在國內外雜志發表學術論文數百篇，其中SCI論文45篇，單篇最高影響因子為7.578。所承擔《口腔組織病理學》已被評為國家級精品課程、國家精品課程視頻公開課程、2014年遴選為吉林大學慕課課程，《口腔生物學》 被評為省級精品課程。《牙合學》為校網絡課程建設項目。參編人衛出版社統編本科生教材3部，研究生教材4部。